Drei Jahre nach seinem Einzug hatte sich das Museum im Rahmen des Möglichen eingerichtet. Das Zentrum der Anlage bildete die Kartäuserkirche mit ausgestellten Kunstwerken. Der Kleine Kreuzgang war als Waffenhalle eingerichtet, von dort gelangte man ins Antiquarium und zu den Folterinstrumenten. Der weitere Weg führte durch die 'Frauenhalle' und das Refektorium ins obere Stockwerk über einen Übergang zu Bibliothek, Archiv und Repertorien. Der Anspruch, mit Ausstellungsräumen vermeintliche Bilder historischen Lebens zu zeigen, ist symptomatisch für die Aufseß'sche Museumsidee. Die 'Zustände', die er in seinem Museumskonzept den historischen Daten und Ereignissen als gleichermaßen zu erforschende Lebenswirklichkeit gegenüberstellte, fanden hier ihren mehr malerisch-subjektiven als wissenschaftlich belegbaren Ausdruck.