Werner lebt 1930-35 in Paris und pflegt enge freundschaftliche Kontakte mit Arp, Mirò, Braque und dem Schriftsteller Carl Einstein. Von Berlin aus kehrt er bis zum Ausbruch des Zweiten Weltkrieges häufig nach Paris zurück. In Deutschland wird Werner erst 1947 durch eine Ausstellung in der Berliner Galerie Rosen öffentlich bekannt. Aufsehen erregt 1955 auf der ersten Kasseler documenta sein 1942 entstandenes Gemälde "Creatio ex Nihilo" (Schöpfung aus dem Nichts). Es ist ein Schlüsselbild seiner abstrakten Konzeption. Für Werner, der sich mit moderner Physik und ihren Theorien über das Universum befasst, haben die Dinge "ihre Gleichniskraft für eine neue Raumvorstellung verloren". Der Künstler müsse danach streben, allein aus dem schöpferischen Akt heraus "Gestalt zu erreichen". Werners Kompositionen sind freie Imaginationen, in denen er das Wesen des "alles umgreifenden Seins" als ständigen schöpferischen Prozess reflektiert. Er selbst bezeichnet seine Bilder als "Sternenbilder, gesehen auf großer Fahrt durch die Räume der Zeit. Konstellationen, die dies und das und anderes bedeuten, die sich wandeln, auflösen und neu konstellieren."

Theodore Werner's painting is greatly influenced by modern physics and its theories on the universe. He understood the artist's creative process as a model of causally operating creativity. His compositions are freely imagined. He himself termed his paintings "Constellations, seen on their great journey through the continuum of space-time. Constellations which mean this and that and something else, which change, disintegrate and reshape themselves."